cyanobase » Prochlorococcus sp. scB243_498L10

Prochlorococcus sp. scB243_498L10

Summary

? | +/- | Top
Data source name GCA_000635035.1
Full name Prochlorococcus sp. scB243_498L10 External
Taxonomy Lineage Cyanobacteria; Prochlorales; Prochlorococcaceae; Prochlorococcus.

Genome Information

? | +/- | Top
Chromosomes
Name Size (bp) Genes
JFMT01000294 137,672 0
JFMT01000295 131,839 0
JFMT01000291 126,018 0
JFMT01000288 120,237 0
JFMT01000001 103,864 0
JFMT01000313 87,017 0
JFMT01000220 58,825 0
JFMT01000149 57,495 0
JFMT01000312 53,130 0
JFMT01000181 47,501 0
JFMT01000311 24,953 0
JFMT01000243 24,699 0
JFMT01000150 24,684 0
JFMT01000003 19,945 0
JFMT01000362 18,338 0
JFMT01000153 17,792 0
JFMT01000290 17,370 0
JFMT01000051 12,479 0
JFMT01000097 10,934 0
JFMT01000287 10,722 0
JFMT01000289 10,605 0
JFMT01000372 7,629 0
JFMT01000175 6,489 0
JFMT01000152 5,773 0
JFMT01000053 5,117 0
JFMT01000002 5,030 0
JFMT01000361 4,887 0
JFMT01000174 3,643 0
JFMT01000315 3,369 0
JFMT01000154 3,249 0
JFMT01000151 3,198 0
JFMT01000189 2,882 0
JFMT01000219 2,850 0
JFMT01000316 2,815 0
JFMT01000158 2,608 0
JFMT01000221 2,396 0
JFMT01000179 2,363 0
JFMT01000060 2,328 0
JFMT01000167 2,176 0
JFMT01000093 1,979 0
JFMT01000157 1,828 0
JFMT01000159 1,765 0
JFMT01000059 1,730 0
JFMT01000200 1,677 0
JFMT01000098 1,628 0
JFMT01000337 1,604 0
JFMT01000335 1,588 0
JFMT01000155 1,513 0
JFMT01000333 1,494 0
JFMT01000336 1,454 0
JFMT01000286 1,388 0
JFMT01000318 1,387 0
JFMT01000103 1,375 0
JFMT01000314 1,359 0
JFMT01000092 1,343 0
JFMT01000282 1,239 0
JFMT01000268 1,204 0
JFMT01000328 1,074 0
JFMT01000148 1,068 0
JFMT01000327 1,056 0
JFMT01000094 1,054 0
JFMT01000156 1,046 0
JFMT01000331 1,029 0
JFMT01000360 994 0
JFMT01000144 993 0
JFMT01000247 989 0
JFMT01000198 982 0
JFMT01000046 977 0
JFMT01000061 965 0
JFMT01000292 964 0
JFMT01000317 953 0
JFMT01000190 950 0
JFMT01000199 916 0
JFMT01000178 901 0
JFMT01000235 899 0
JFMT01000196 894 0
JFMT01000309 892 0
JFMT01000049 887 0
JFMT01000101 868 0
JFMT01000107 863 0
JFMT01000275 858 0
JFMT01000176 840 0
JFMT01000183 831 0
JFMT01000273 805 0
JFMT01000165 805 0
JFMT01000052 803 0
JFMT01000042 796 0
JFMT01000302 789 0
JFMT01000169 787 0
JFMT01000110 783 0
JFMT01000242 781 0
JFMT01000230 773 0
JFMT01000109 773 0
JFMT01000050 773 0
JFMT01000058 770 0
JFMT01000297 746 0
JFMT01000164 706 0
JFMT01000232 704 0
JFMT01000054 704 0
JFMT01000310 703 0
JFMT01000263 702 0
JFMT01000186 702 0
JFMT01000379 691 0
JFMT01000170 676 0
JFMT01000006 674 0
JFMT01000307 670 0
JFMT01000365 663 0
JFMT01000266 651 0
JFMT01000111 643 0
JFMT01000195 642 0
JFMT01000031 641 0
JFMT01000171 628 0
JFMT01000026 628 0
JFMT01000344 626 0
JFMT01000168 610 0
JFMT01000332 608 0
JFMT01000007 607 0
JFMT01000236 602 0
JFMT01000237 585 0
JFMT01000330 571 0
JFMT01000223 567 0
JFMT01000172 561 0
JFMT01000018 554 0
JFMT01000184 547 0
JFMT01000222 544 0
JFMT01000180 539 0
JFMT01000211 536 0
JFMT01000114 530 0
JFMT01000370 529 0
JFMT01000201 527 0
JFMT01000064 522 0
JFMT01000014 517 0
JFMT01000253 517 0
JFMT01000191 515 0
JFMT01000281 512 0
JFMT01000040 511 0
JFMT01000037 501 0
JFMT01000210 500 0
JFMT01000269 500 0
JFMT01000213 497 0
JFMT01000355 497 0
JFMT01000021 493 0
JFMT01000304 489 0
JFMT01000258 488 0
JFMT01000108 488 0
JFMT01000055 486 0
JFMT01000129 484 0
JFMT01000257 483 0
JFMT01000216 476 0
JFMT01000308 474 0
JFMT01000193 473 0
JFMT01000285 472 0
JFMT01000209 463 0
JFMT01000227 459 0
JFMT01000023 456 0
JFMT01000283 456 0
JFMT01000259 451 0
JFMT01000066 449 0
JFMT01000084 448 0
JFMT01000305 442 0
JFMT01000229 441 0
JFMT01000121 440 0
JFMT01000138 440 0
JFMT01000142 439 0
JFMT01000043 438 0
JFMT01000017 438 0
JFMT01000039 433 0
JFMT01000245 432 0
JFMT01000136 428 0
JFMT01000106 428 0
JFMT01000072 427 0
JFMT01000123 421 0
JFMT01000173 418 0
JFMT01000194 418 0
JFMT01000009 415 0
JFMT01000306 415 0
JFMT01000238 410 0
JFMT01000338 408 0
JFMT01000140 407 0
JFMT01000008 407 0
JFMT01000321 406 0
JFMT01000182 405 0
JFMT01000320 404 0
JFMT01000088 403 0
JFMT01000326 403 0
JFMT01000137 397 0
JFMT01000343 395 0
JFMT01000202 395 0
JFMT01000197 394 0
JFMT01000113 389 0
JFMT01000381 388 0
JFMT01000267 387 0
JFMT01000102 386 0
JFMT01000057 383 0
JFMT01000325 381 0
JFMT01000241 380 0
JFMT01000139 378 0
JFMT01000147 374 0
JFMT01000177 371 0
JFMT01000062 366 0
JFMT01000048 365 0
JFMT01000218 365 0
JFMT01000128 365 0
JFMT01000160 364 0
JFMT01000115 361 0
JFMT01000132 361 0
JFMT01000063 357 0
JFMT01000373 355 0
JFMT01000035 355 0
JFMT01000371 355 0
JFMT01000279 355 0
JFMT01000085 352 0
JFMT01000233 349 0
JFMT01000100 349 0
JFMT01000188 347 0
JFMT01000334 347 0
JFMT01000358 345 0
JFMT01000274 345 0
JFMT01000082 340 0
JFMT01000074 340 0
JFMT01000322 338 0
JFMT01000217 338 0
JFMT01000354 337 0
JFMT01000208 335 0
JFMT01000366 335 0
JFMT01000255 334 0
JFMT01000033 331 0
JFMT01000022 330 0
JFMT01000099 329 0
JFMT01000261 325 0
JFMT01000079 325 0
JFMT01000300 323 0
JFMT01000265 323 0
JFMT01000353 322 0
JFMT01000341 321 0
JFMT01000019 320 0
JFMT01000329 319 0
JFMT01000124 319 0
JFMT01000323 319 0
JFMT01000010 318 0
JFMT01000087 318 0
JFMT01000029 318 0
JFMT01000032 317 0
JFMT01000133 317 0
JFMT01000069 316 0
JFMT01000045 315 0
JFMT01000041 312 0
JFMT01000163 310 0
JFMT01000056 308 0
JFMT01000346 308 0
JFMT01000096 306 0
JFMT01000105 306 0
JFMT01000296 304 0
JFMT01000071 304 0
JFMT01000342 303 0
JFMT01000187 301 0
JFMT01000228 299 0
JFMT01000116 297 0
JFMT01000369 296 0
JFMT01000104 296 0
JFMT01000339 295 0
JFMT01000020 295 0
JFMT01000298 295 0
JFMT01000185 294 0
JFMT01000340 293 0
JFMT01000091 292 0
JFMT01000044 291 0
JFMT01000345 290 0
JFMT01000027 288 0
JFMT01000254 287 0
JFMT01000348 287 0
JFMT01000166 286 0
JFMT01000161 285 0
JFMT01000145 285 0
JFMT01000081 285 0
JFMT01000095 284 0
JFMT01000036 282 0
JFMT01000352 282 0
JFMT01000090 282 0
JFMT01000030 281 0
JFMT01000224 280 0
JFMT01000248 280 0
JFMT01000351 278 0
JFMT01000078 276 0
JFMT01000214 276 0
JFMT01000303 276 0
JFMT01000301 275 0
JFMT01000276 275 0
JFMT01000234 275 0
JFMT01000277 274 0
JFMT01000076 273 0
JFMT01000280 273 0
JFMT01000249 271 0
JFMT01000012 269 0
JFMT01000065 266 0
JFMT01000262 265 0
JFMT01000120 265 0
JFMT01000375 263 0
JFMT01000363 262 0
JFMT01000024 261 0
JFMT01000272 260 0
JFMT01000192 259 0
JFMT01000256 258 0
JFMT01000380 256 0
JFMT01000122 256 0
JFMT01000131 256 0
JFMT01000112 254 0
JFMT01000376 254 0
JFMT01000240 254 0
JFMT01000246 252 0
JFMT01000141 250 0
JFMT01000251 248 0
JFMT01000252 248 0
JFMT01000284 248 0
JFMT01000260 247 0
JFMT01000119 246 0
JFMT01000347 245 0
JFMT01000013 245 0
JFMT01000368 244 0
JFMT01000364 244 0
JFMT01000125 243 0
JFMT01000070 243 0
JFMT01000089 242 0
JFMT01000357 242 0
JFMT01000130 240 0
JFMT01000271 240 0
JFMT01000377 238 0
JFMT01000143 237 0
JFMT01000356 235 0
JFMT01000278 235 0
JFMT01000226 234 0
JFMT01000244 232 0
JFMT01000034 232 0
JFMT01000118 231 0
JFMT01000225 230 0
JFMT01000073 230 0
JFMT01000239 227 0
JFMT01000146 225 0
JFMT01000028 224 0
JFMT01000083 223 0
JFMT01000162 222 0
JFMT01000126 222 0
JFMT01000204 222 0
JFMT01000205 221 0
JFMT01000004 219 0
JFMT01000270 219 0
JFMT01000293 217 0
JFMT01000215 217 0
JFMT01000117 217 0
JFMT01000350 216 0
JFMT01000231 216 0
JFMT01000378 216 0
JFMT01000135 215 0
JFMT01000068 215 0
JFMT01000127 214 0
JFMT01000067 214 0
JFMT01000374 214 0
JFMT01000264 213 0
JFMT01000359 213 0
JFMT01000134 211 0
JFMT01000077 210 0
JFMT01000080 209 0
JFMT01000005 209 0
JFMT01000075 209 0
JFMT01000206 208 0
JFMT01000319 207 0
JFMT01000250 206 0
JFMT01000349 206 0
JFMT01000207 205 0
JFMT01000203 204 0
JFMT01000086 203 0
JFMT01000011 203 0
JFMT01000038 202 0
JFMT01000016 202 0
JFMT01000015 202 0
JFMT01000212 201 0
JFMT01000025 201 0
JFMT01000047 200 0
JFMT01000299 200 0
JFMT01000367 200 0
JFMT01000324 200 0
Total 1,348,564 0
Features FeaturesView : 0 features

Genes

? | +/- | Top
List GenesView csv txt FAA
Geneset GenesetView
Function category GeneCategoryView csv txt
Annotation Gene Annotation WordCloudView

Tools and analysis

? | +/- | Top
BLAST2
KazusaMart Dataset GCA_000635035.1

Genome-scale data

? | +/- | Top
Curated mutant information Genes and Mutants - as known as CyanoGenes/Mutants
Proteome
Interactome
Transcriptome
Bibliome References from Kazusa GeneIndexing articles External

Bibliography

? | +/- | Top
References
Gene Indexing Kazusa GeneIndexing articles External Feed-icon

Resources

? | +/- | Top
Data dowonload Distribution of Sequence and Annotated Data Files (FTP) External
Sequence data INSDB DNA DataBank FlatFiles External
Social genome annotation
DAS service
NCBI Taxonomy Taxonomy ID: External
KEGG GENOME External
UniProt taxonomy: in UniProt External

API

? | +/- | Top
Genomes Chromosomes/Plasmids
Genes File format:
ColumnDescription or example
1Data source nameSynechocystis
2IDslr1311
3Chromosome nameChr
4Start position7229
5End position8311
6Orientation+ or -
7Definitionphotosystem II D1 protein
Protein sequences /cyanobase/GCA_000635035.1/genes.faa -- AminoAcids sequence in Fasta format.
Nucleotide sequences
Gene symbols /cyanobase/GCA_000635035.1/genes/search/dsn/gene_symbol.txt (File format)
GeneIndex gnames /cyanobase/GCA_000635035.1/genes/search/dsn/gi_gname.txt (File format)
Gene function category File format:
ColumnDescription or example
1Gene IDsll0084
2Gene Deffinitionputative phosphatase
3First category IDA
4First category nameAmino acid biosynthesis
5Second category IDA1
6Second category nameAromatic amino acid family
Gene annotation word clouds /cyanobase/GCA_000635035.1/genes/word_cloud.txt -- tab delimitered text format.
File format:
ColumnDescription or example
1Word
2CountInteger
/cyanobase/GCA_000635035.1/genes/word_cloud?style=plain -- Plain view in html
/cyanobase/GCA_000635035.1/genes/word_cloud?c=10 -- 10 counts cut-off in html.
GO Terms by ipr2go /api/cyanobase/GCA_000635035.1/genes/goterm.txt (File format)
InterProScan matches /api/cyanobase/GCA_000635035.1/genes/interpro.txt (File format)

Kazusa DNA Research Institute

Licence and disclaimer