cyanobase » Prochlorococcus sp. scB245a_520B18

Prochlorococcus sp. scB245a_520B18

Summary

? | +/- | Top
Data source name GCA_000634475.1
Full name Prochlorococcus sp. scB245a_520B18 External
Taxonomy Lineage Cyanobacteria; Prochlorales; Prochlorococcaceae; Prochlorococcus.

Genome Information

? | +/- | Top
Chromosomes
Name Size (bp) Genes
JFNQ01000071 129,630 0
JFNQ01000318 109,353 0
JFNQ01000310 94,213 0
JFNQ01000317 92,339 0
JFNQ01000319 75,012 0
JFNQ01000302 59,506 0
JFNQ01000311 49,489 0
JFNQ01000304 46,826 0
JFNQ01000378 44,895 0
JFNQ01000305 43,612 0
JFNQ01000321 40,027 0
JFNQ01000379 33,570 0
JFNQ01000314 31,560 0
JFNQ01000443 30,836 0
JFNQ01000074 27,194 0
JFNQ01000303 26,632 0
JFNQ01000308 22,931 0
JFNQ01000306 20,792 0
JFNQ01000307 20,297 0
JFNQ01000315 20,056 0
JFNQ01000078 19,942 0
JFNQ01000072 18,194 0
JFNQ01000076 17,111 0
JFNQ01000320 14,949 0
JFNQ01000075 12,202 0
JFNQ01000322 11,941 0
JFNQ01000083 11,215 0
JFNQ01000088 8,260 0
JFNQ01000380 7,504 0
JFNQ01000313 6,203 0
JFNQ01000324 6,125 0
JFNQ01000381 6,102 0
JFNQ01000080 5,826 0
JFNQ01000384 5,471 0
JFNQ01000133 4,561 0
JFNQ01000084 4,509 0
JFNQ01000117 4,367 0
JFNQ01000098 3,663 0
JFNQ01000323 3,426 0
JFNQ01000312 3,142 0
JFNQ01000309 2,919 0
JFNQ01000094 2,833 0
JFNQ01000085 2,824 0
JFNQ01000077 2,789 0
JFNQ01000445 2,755 0
JFNQ01000179 2,476 0
JFNQ01000386 2,348 0
JFNQ01000101 2,284 0
JFNQ01000096 2,167 0
JFNQ01000327 2,148 0
JFNQ01000112 2,036 0
JFNQ01000326 1,986 0
JFNQ01000107 1,967 0
JFNQ01000104 1,936 0
JFNQ01000090 1,894 0
JFNQ01000114 1,739 0
JFNQ01000125 1,737 0
JFNQ01000093 1,670 0
JFNQ01000082 1,668 0
JFNQ01000092 1,661 0
JFNQ01000444 1,628 0
JFNQ01000134 1,520 0
JFNQ01000135 1,465 0
JFNQ01000130 1,460 0
JFNQ01000073 1,457 0
JFNQ01000087 1,415 0
JFNQ01000002 1,405 0
JFNQ01000116 1,372 0
JFNQ01000095 1,350 0
JFNQ01000086 1,337 0
JFNQ01000079 1,312 0
JFNQ01000100 1,310 0
JFNQ01000127 1,274 0
JFNQ01000119 1,258 0
JFNQ01000089 1,234 0
JFNQ01000151 1,227 0
JFNQ01000142 1,211 0
JFNQ01000387 1,188 0
JFNQ01000126 1,185 0
JFNQ01000103 1,175 0
JFNQ01000454 1,127 0
JFNQ01000108 1,118 0
JFNQ01000137 1,111 0
JFNQ01000316 1,104 0
JFNQ01000328 1,085 0
JFNQ01000099 1,078 0
JFNQ01000385 1,058 0
JFNQ01000118 1,046 0
JFNQ01000156 1,018 0
JFNQ01000453 1,011 0
JFNQ01000115 995 0
JFNQ01000001 990 0
JFNQ01000446 987 0
JFNQ01000106 980 0
JFNQ01000213 972 0
JFNQ01000109 971 0
JFNQ01000139 969 0
JFNQ01000382 967 0
JFNQ01000129 966 0
JFNQ01000120 959 0
JFNQ01000121 949 0
JFNQ01000110 943 0
JFNQ01000009 932 0
JFNQ01000149 887 0
JFNQ01000010 879 0
JFNQ01000113 873 0
JFNQ01000138 844 0
JFNQ01000081 838 0
JFNQ01000141 831 0
JFNQ01000111 818 0
JFNQ01000097 813 0
JFNQ01000190 800 0
JFNQ01000188 792 0
JFNQ01000140 790 0
JFNQ01000102 787 0
JFNQ01000132 782 0
JFNQ01000325 775 0
JFNQ01000178 764 0
JFNQ01000168 756 0
JFNQ01000452 752 0
JFNQ01000456 741 0
JFNQ01000220 738 0
JFNQ01000123 730 0
JFNQ01000136 710 0
JFNQ01000246 709 0
JFNQ01000122 702 0
JFNQ01000091 690 0
JFNQ01000391 688 0
JFNQ01000408 688 0
JFNQ01000461 686 0
JFNQ01000202 685 0
JFNQ01000176 682 0
JFNQ01000341 679 0
JFNQ01000160 676 0
JFNQ01000215 673 0
JFNQ01000128 666 0
JFNQ01000193 665 0
JFNQ01000393 662 0
JFNQ01000383 660 0
JFNQ01000124 659 0
JFNQ01000389 642 0
JFNQ01000450 638 0
JFNQ01000447 635 0
JFNQ01000019 633 0
JFNQ01000448 632 0
JFNQ01000169 632 0
JFNQ01000131 631 0
JFNQ01000185 623 0
JFNQ01000152 622 0
JFNQ01000397 619 0
JFNQ01000232 610 0
JFNQ01000201 609 0
JFNQ01000400 607 0
JFNQ01000472 607 0
JFNQ01000210 592 0
JFNQ01000175 591 0
JFNQ01000218 581 0
JFNQ01000392 573 0
JFNQ01000398 573 0
JFNQ01000416 572 0
JFNQ01000217 571 0
JFNQ01000212 570 0
JFNQ01000390 569 0
JFNQ01000154 566 0
JFNQ01000406 565 0
JFNQ01000199 564 0
JFNQ01000451 564 0
JFNQ01000192 559 0
JFNQ01000414 558 0
JFNQ01000205 557 0
JFNQ01000164 556 0
JFNQ01000155 550 0
JFNQ01000455 549 0
JFNQ01000143 548 0
JFNQ01000180 548 0
JFNQ01000013 545 0
JFNQ01000165 543 0
JFNQ01000195 542 0
JFNQ01000331 539 0
JFNQ01000153 530 0
JFNQ01000292 528 0
JFNQ01000018 525 0
JFNQ01000007 524 0
JFNQ01000166 522 0
JFNQ01000388 515 0
JFNQ01000145 515 0
JFNQ01000336 511 0
JFNQ01000182 511 0
JFNQ01000238 508 0
JFNQ01000458 505 0
JFNQ01000014 497 0
JFNQ01000171 496 0
JFNQ01000163 494 0
JFNQ01000233 487 0
JFNQ01000396 486 0
JFNQ01000005 486 0
JFNQ01000147 484 0
JFNQ01000226 480 0
JFNQ01000364 480 0
JFNQ01000039 476 0
JFNQ01000105 472 0
JFNQ01000183 468 0
JFNQ01000015 464 0
JFNQ01000170 459 0
JFNQ01000342 456 0
JFNQ01000468 455 0
JFNQ01000252 450 0
JFNQ01000172 448 0
JFNQ01000420 447 0
JFNQ01000227 447 0
JFNQ01000265 444 0
JFNQ01000181 444 0
JFNQ01000150 443 0
JFNQ01000403 440 0
JFNQ01000041 440 0
JFNQ01000405 439 0
JFNQ01000269 438 0
JFNQ01000404 437 0
JFNQ01000187 436 0
JFNQ01000146 427 0
JFNQ01000207 424 0
JFNQ01000449 424 0
JFNQ01000394 423 0
JFNQ01000395 423 0
JFNQ01000208 420 0
JFNQ01000402 416 0
JFNQ01000045 414 0
JFNQ01000033 413 0
JFNQ01000359 411 0
JFNQ01000024 407 0
JFNQ01000209 407 0
JFNQ01000460 404 0
JFNQ01000407 404 0
JFNQ01000347 403 0
JFNQ01000197 403 0
JFNQ01000457 402 0
JFNQ01000254 397 0
JFNQ01000174 395 0
JFNQ01000191 394 0
JFNQ01000411 393 0
JFNQ01000284 392 0
JFNQ01000189 391 0
JFNQ01000177 390 0
JFNQ01000162 387 0
JFNQ01000211 383 0
JFNQ01000296 383 0
JFNQ01000216 381 0
JFNQ01000161 381 0
JFNQ01000157 378 0
JFNQ01000196 376 0
JFNQ01000377 376 0
JFNQ01000245 375 0
JFNQ01000241 374 0
JFNQ01000330 371 0
JFNQ01000025 371 0
JFNQ01000028 369 0
JFNQ01000144 368 0
JFNQ01000159 366 0
JFNQ01000401 364 0
JFNQ01000418 364 0
JFNQ01000463 363 0
JFNQ01000194 362 0
JFNQ01000158 361 0
JFNQ01000409 359 0
JFNQ01000251 358 0
JFNQ01000340 357 0
JFNQ01000029 356 0
JFNQ01000229 356 0
JFNQ01000184 355 0
JFNQ01000466 352 0
JFNQ01000300 351 0
JFNQ01000148 351 0
JFNQ01000248 349 0
JFNQ01000350 348 0
JFNQ01000348 347 0
JFNQ01000410 346 0
JFNQ01000242 346 0
JFNQ01000221 345 0
JFNQ01000352 344 0
JFNQ01000286 343 0
JFNQ01000037 341 0
JFNQ01000366 341 0
JFNQ01000206 341 0
JFNQ01000474 341 0
JFNQ01000415 340 0
JFNQ01000062 339 0
JFNQ01000023 338 0
JFNQ01000419 336 0
JFNQ01000362 335 0
JFNQ01000244 334 0
JFNQ01000283 333 0
JFNQ01000353 332 0
JFNQ01000437 331 0
JFNQ01000433 330 0
JFNQ01000473 330 0
JFNQ01000257 328 0
JFNQ01000200 327 0
JFNQ01000281 327 0
JFNQ01000225 324 0
JFNQ01000421 324 0
JFNQ01000428 323 0
JFNQ01000343 321 0
JFNQ01000365 320 0
JFNQ01000430 318 0
JFNQ01000355 317 0
JFNQ01000280 316 0
JFNQ01000335 314 0
JFNQ01000047 314 0
JFNQ01000299 314 0
JFNQ01000271 314 0
JFNQ01000008 313 0
JFNQ01000060 311 0
JFNQ01000291 311 0
JFNQ01000429 311 0
JFNQ01000337 310 0
JFNQ01000167 310 0
JFNQ01000258 308 0
JFNQ01000462 307 0
JFNQ01000261 306 0
JFNQ01000273 306 0
JFNQ01000346 305 0
JFNQ01000186 304 0
JFNQ01000356 303 0
JFNQ01000250 301 0
JFNQ01000399 299 0
JFNQ01000288 299 0
JFNQ01000459 299 0
JFNQ01000004 299 0
JFNQ01000256 299 0
JFNQ01000253 294 0
JFNQ01000329 293 0
JFNQ01000231 293 0
JFNQ01000294 292 0
JFNQ01000042 292 0
JFNQ01000293 291 0
JFNQ01000354 290 0
JFNQ01000363 289 0
JFNQ01000373 288 0
JFNQ01000026 288 0
JFNQ01000203 287 0
JFNQ01000262 286 0
JFNQ01000469 284 0
JFNQ01000435 281 0
JFNQ01000070 280 0
JFNQ01000223 279 0
JFNQ01000422 279 0
JFNQ01000368 278 0
JFNQ01000279 277 0
JFNQ01000290 277 0
JFNQ01000011 276 0
JFNQ01000237 276 0
JFNQ01000173 276 0
JFNQ01000301 276 0
JFNQ01000204 275 0
JFNQ01000298 275 0
JFNQ01000234 275 0
JFNQ01000040 275 0
JFNQ01000345 275 0
JFNQ01000423 274 0
JFNQ01000361 273 0
JFNQ01000289 272 0
JFNQ01000012 270 0
JFNQ01000412 270 0
JFNQ01000270 269 0
JFNQ01000198 268 0
JFNQ01000236 268 0
JFNQ01000371 267 0
JFNQ01000043 266 0
JFNQ01000282 266 0
JFNQ01000465 266 0
JFNQ01000235 265 0
JFNQ01000239 264 0
JFNQ01000016 264 0
JFNQ01000413 263 0
JFNQ01000276 262 0
JFNQ01000048 262 0
JFNQ01000003 259 0
JFNQ01000049 259 0
JFNQ01000036 257 0
JFNQ01000066 256 0
JFNQ01000266 254 0
JFNQ01000471 253 0
JFNQ01000022 252 0
JFNQ01000334 251 0
JFNQ01000287 251 0
JFNQ01000247 251 0
JFNQ01000240 248 0
JFNQ01000277 248 0
JFNQ01000467 248 0
JFNQ01000272 248 0
JFNQ01000369 246 0
JFNQ01000376 245 0
JFNQ01000344 245 0
JFNQ01000360 244 0
JFNQ01000219 243 0
JFNQ01000417 242 0
JFNQ01000249 240 0
JFNQ01000285 240 0
JFNQ01000260 240 0
JFNQ01000436 239 0
JFNQ01000038 238 0
JFNQ01000255 238 0
JFNQ01000264 237 0
JFNQ01000432 236 0
JFNQ01000243 235 0
JFNQ01000440 235 0
JFNQ01000031 235 0
JFNQ01000431 233 0
JFNQ01000424 232 0
JFNQ01000224 231 0
JFNQ01000464 230 0
JFNQ01000439 229 0
JFNQ01000332 229 0
JFNQ01000065 229 0
JFNQ01000297 229 0
JFNQ01000006 229 0
JFNQ01000275 229 0
JFNQ01000214 226 0
JFNQ01000228 226 0
JFNQ01000259 225 0
JFNQ01000357 225 0
JFNQ01000351 225 0
JFNQ01000021 223 0
JFNQ01000053 222 0
JFNQ01000274 222 0
JFNQ01000054 222 0
JFNQ01000278 222 0
JFNQ01000267 219 0
JFNQ01000426 219 0
JFNQ01000064 218 0
JFNQ01000358 217 0
JFNQ01000263 216 0
JFNQ01000027 216 0
JFNQ01000067 215 0
JFNQ01000230 214 0
JFNQ01000057 214 0
JFNQ01000470 214 0
JFNQ01000059 213 0
JFNQ01000050 213 0
JFNQ01000268 212 0
JFNQ01000339 212 0
JFNQ01000442 212 0
JFNQ01000035 212 0
JFNQ01000375 212 0
JFNQ01000374 211 0
JFNQ01000061 211 0
JFNQ01000338 211 0
JFNQ01000295 210 0
JFNQ01000017 210 0
JFNQ01000055 208 0
JFNQ01000370 208 0
JFNQ01000058 208 0
JFNQ01000063 207 0
JFNQ01000069 207 0
JFNQ01000333 206 0
JFNQ01000044 206 0
JFNQ01000425 206 0
JFNQ01000046 206 0
JFNQ01000427 206 0
JFNQ01000034 205 0
JFNQ01000222 204 0
JFNQ01000030 204 0
JFNQ01000051 203 0
JFNQ01000349 203 0
JFNQ01000434 203 0
JFNQ01000372 203 0
JFNQ01000020 202 0
JFNQ01000068 201 0
JFNQ01000032 201 0
JFNQ01000441 201 0
JFNQ01000056 201 0
JFNQ01000367 200 0
JFNQ01000052 200 0
JFNQ01000438 200 0
Total 1,430,675 0
Features FeaturesView : 0 features

Genes

? | +/- | Top
List GenesView csv txt FAA
Geneset GenesetView
Function category GeneCategoryView csv txt
Annotation Gene Annotation WordCloudView

Tools and analysis

? | +/- | Top
BLAST2
KazusaMart Dataset GCA_000634475.1

Genome-scale data

? | +/- | Top
Curated mutant information Genes and Mutants - as known as CyanoGenes/Mutants
Proteome
Interactome
Transcriptome
Bibliome References from Kazusa GeneIndexing articles External

Bibliography

? | +/- | Top
References
Gene Indexing Kazusa GeneIndexing articles External Feed-icon

Resources

? | +/- | Top
Data dowonload Distribution of Sequence and Annotated Data Files (FTP) External
Sequence data INSDB DNA DataBank FlatFiles External
Social genome annotation
DAS service
NCBI Taxonomy Taxonomy ID: External
KEGG GENOME External
UniProt taxonomy: in UniProt External

API

? | +/- | Top
Genomes Chromosomes/Plasmids
Genes File format:
ColumnDescription or example
1Data source nameSynechocystis
2IDslr1311
3Chromosome nameChr
4Start position7229
5End position8311
6Orientation+ or -
7Definitionphotosystem II D1 protein
Protein sequences /cyanobase/GCA_000634475.1/genes.faa -- AminoAcids sequence in Fasta format.
Nucleotide sequences
Gene symbols /cyanobase/GCA_000634475.1/genes/search/dsn/gene_symbol.txt (File format)
GeneIndex gnames /cyanobase/GCA_000634475.1/genes/search/dsn/gi_gname.txt (File format)
Gene function category File format:
ColumnDescription or example
1Gene IDsll0084
2Gene Deffinitionputative phosphatase
3First category IDA
4First category nameAmino acid biosynthesis
5Second category IDA1
6Second category nameAromatic amino acid family
Gene annotation word clouds /cyanobase/GCA_000634475.1/genes/word_cloud.txt -- tab delimitered text format.
File format:
ColumnDescription or example
1Word
2CountInteger
/cyanobase/GCA_000634475.1/genes/word_cloud?style=plain -- Plain view in html
/cyanobase/GCA_000634475.1/genes/word_cloud?c=10 -- 10 counts cut-off in html.
GO Terms by ipr2go /api/cyanobase/GCA_000634475.1/genes/goterm.txt (File format)
InterProScan matches /api/cyanobase/GCA_000634475.1/genes/interpro.txt (File format)

Kazusa DNA Research Institute

Licence and disclaimer